Les instances centrales de gestion sont les suivantes :
- Le Secrétariat General,
Il coordonne le travail des services administratifs (direction de la bibliothèque, direction de la scolarité, services des ressources humaines, services des finances, service du domaine, service médical, centre des ressources de Dakar, service des sports), et assure donc, sous l’autorité du Recteur, l’administration de l’Université.
Par ailleurs, il rédige les procès verbaux (CA, AU, réunion de coordination, etc.), participe a l’élaboration du budget, délivre les ordres de missions et signe les documents relatifs aux attestations, et a leur authentification.
- L’Agence comptable :
Il doit faire les diligences nécessaires pour la production des droits et produits portes au budget dont il a la charge
Il arrête ses écritures au dernier jour de l’année financière à l’issue de la période complémentaire
Il fait la vérification des mandats et ordre de paiement qui lui sont adresses
Il procède au paiement des commandes et aux prestations des services
Il fait la tenue de la caisse unique dont il est le seul responsable pécuniairement
Il exécute les opérations de trésorerie sous l’autorité du Ministre charge des Finances
Il établit la situation des opérations budgétaires par trimestre
Il établie les comptes de gestion annuelles des établissements
Il exerce une action de contrôle sur les actes des ordonnateurs de budget